En gnome:
Ir a la carpeta personal (que se encuentra en /home/USUARIO), menú VER -> MOSTRAR ARCHIVOS OCULTOS.
Luego editar el archivo .bashrc y al final agregar las siguientes líneas (donde se debe cambiar USUARIO por el nombre de usuario, CONTRASEÑA por la contraseña de autenticación ante el proxy, DIRECCIONPROXY por la dirección del proxy, y PUERTO por el puerto a través del cual se conecta):
http_proxy="http://USUARIO:CONTRASEÑA@DIRECCIONPROXY:PUERTO"
ftp_proxy="http://USUARIO:CONTRASEÑA@DIRECCIONPROXY:PUERTO"
export http_proxy
export ftp_proxy
Para mi caso particular, que estudio en la UNIVERSIDAD NACIONAL DE COLOMBIA, los datos serían algo como esto:
http_proxy="http://USUARIO:CONTRASEÑA@proxy.unal.edu.co:8080"
ftp_proxy="http://USUARIO:CONTRASEÑA@proxyftp.unal.edu.co:8080"
export http_proxy
export ftp_proxy
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